Иван Голованицкий родился в 1795 году в селе Староселье Киевской губернии в семье местного православного священника. С 1806 года обучался в Киевской духовной семинарии, но притесняемый своим собственным братом — учителем, в 1813 году оставил семинарию и поступил в Нижегородское ополчение[1].
В 1815 году Иван Фёдорович Голованицкий поступил послушником в Киево-Печерскую лавру, был затем в Иверско-Софрониевой и Глинской пустынях и в последней принял малое пострижение с именем Иоиля, а в 1824 году — полное с именем Иоанникия; в том же году рукоположен в иеродиакона[1].
6 августа 1840 года отец Илиодор назначен архимандритом Петропавловского монастыря Глуховского уезда[1].
6 сентября 1845 года Илиодор Голованицкий освобождён от должности по состоянию здоровья и поселился в Глинской пустыни, приняв на себя «подвиг миротворца»[1]. Был духовным наставником Николая Дробязгина.
С 1863 года совсем уединился в лесу, где умер 11 июля (28.06.ст.ст.) 1879 года[1].
По отзывам современников: он был инок очень строгой жизни; говорили, что он обладал даром прозорливости; в течение своей жизни ему пришлось встретить немало недоброжелателей, завистников и клеветников[1].
