Русская Википедия:Неравновесное сцепление генов
Материал из Онлайн справочника
Неравновесное сцепление генов (Шаблон:Lang-en (LD)) — неслучайное распределение частот аллелей разных локусов, которое может быть обусловлено не только тесным генетическим сцеплением генов, но и наличием адаптивного преимущества конкретной комбинации аллелей, частота которой соответственно возрастает в сравнении с частотой, ожидаемой при случайном распределении.
Программы для вычисления LD
- LiAn - Linkage Analysis 3.7 Шаблон:Wayback (Ias) (online)
- Arlequin 3.5 Шаблон:Wayback (p-values, D, D', r², χ²) (Windows)
- LinkDos on the Web Шаблон:Wayback (Δ, D, D') (online)
- MultiLocus 1.3b Шаблон:Wayback (Ia, rd) (Windows, MacOS)
- MIDAS - Multiallelic Interallelic Disequilibrium Analysis Software 1.0 (Python, Windows, Linux)
Визуализация
- JLIN - Java based Linkage Disequilibrium plotter 1.6.0 (Java)
- GOLD - Graphical Overview of Linkage Disequilibrium Шаблон:Wayback (Windows)
Ссылки
- Mueller J.C. Linkage disequilibrium for different scales and applications. Brief Bioinform. 2004, 5:355-364. Шаблон:Wayback
- A Compilation of Some Available Software for Linkage Disequilibrium Analysis
Шаблон:Genetics-stub Шаблон:Rq
