Русская Википедия:Тиоредоксиновая укладка

Материал из Онлайн справочника
Версия от 05:20, 20 сентября 2023; EducationBot (обсуждение | вклад) (Новая страница: «{{Русская Википедия/Панель перехода}} {{Семейство белков | Symbol = Thioredoxin, Trx | Name = Тиоредоксин | image = Thioredoxin-fold-1ert.png | width = | caption = Одна молекула человеческого тиоредоксина (PDB ID 1ERT), канонический пример тиоредоксиновой укладки. | Pfam = PF00085 | Pfam_clan = CL0172 | Interpro = IPR01376...»)
(разн.) ← Предыдущая версия | Текущая версия (разн.) | Следующая версия → (разн.)
Перейти к навигацииПерейти к поиску

Шаблон:Семейство белков Тиоредоксиновая укладка — это белковая укладка, общая для ферментов, катализирующих образование дисульфидной связи и изомеризацию. Укладка названа в честь канонического примера тиоредоксина и обнаруживается как в прокариотических, так и в эукариотических белках. Это пример складки альфа / бета белка, который обладает оксидоредуктазной активностью. Пространственная топология складки состоит из четырёхцепочечного антипараллельного бета-листа, заключённого между тремя альфа-спиралями.

Сохранение последовательности

Несмотря на вариабельность последовательности во многих областях укладки, белки тиоредоксина имеют общую последовательность активного сайта с двумя реактивными остатками цистеина: Cys-X-Y-Cys, где X и Y часто, но не обязательно, являются гидрофобными аминокислотами. Восстановленная форма белка содержит две свободные тиоловые группы у остатков цистеина, тогда как окисленная форма содержит дисульфидную связь между ними.

Образование дисульфидной связи

Различные белки, содержащие тиоредоксиновую укладку, сильно различаются по своей реакционной способности и по pKa их свободных тиолов, что обусловлено способностью общей структуры белка стабилизировать активированный тиолат. Хотя структура довольно универсальна среди белков, содержащих тиоредоксиновую складку, pKa чрезвычайно чувствительна к небольшим изменениям в структуре, особенно к расположению атомов основной цепи белка рядом с первым цистеином.

Примеры

Белки человека, содержащие этот домен, включают:

  • DNAJC10
  • ERP70
  • GLRX3
  • P4HB; P5; PDIA2; PDIA3; PDIA4; PDIA5; PDIA6; PDILT
  • QSOX1; QSOX2
  • STRF8
  • TXN; TXN2; TXNDC1; TXNDC10; TXNDC11; TXNDC13; TXNDC14; TXNDC15; TXNDC16; TXNDC2; TXNDC3; TXNDC4; TXNDC5; TXNDC6; TXNDC8; TXNL1; TXNL3

Примечания

Ссылки

Шаблон:Третичная структура белка