Русская Википедия:Thaumarchaeota
Шаблон:Таксон Thaumarchaeota (лат., от Шаблон:Lang-el — чудо) — тип архей, содержащий по всего 3 культивируемых вида и около 20 кандидатов (Candidatus)Шаблон:Переход. Все открытые на данный момент представители являются хемолитотрофами и окисляют аммиак. Они могут играть важную роль в биохимическом круговороте веществ, в частности круговороте азота.
История изучения
Тип был выделен в 2008 году на основании филогенетических данных, таких как последовательности генов рРНК этих организмов, а также образование ими топоизомеразы I типа, который раньше считался уникальным для эукариот[1][2]. Эти положения были подтверждены дополнительными анализами, результаты которых были опубликованы в 2010 году. В них проверялись геномы окисляющих аммиак архей Nitrosopumilus maritimus и Candidatus Nitrososphaera gargensis. По результатам этих исследований было установлено, что эти два вида имеют отдельное происхождение вместе с другим видом, Cenarchaeum symbiosum, который был первым описанным видом Thaumarchaeota[3].
Классификация
Современная классификация базируется на данных List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), а также Национального центра биотехнологической информации (NCBI). Если на июль 2017 года в первом источнике тип представлен единственным видом Nitrososphaera viennensis[4] из класса Nitrososphaeria[5], то второй включает большее число таксонов рангом от вида до порядка, из которых большая часть — кандидаты. В классификации ниже показаны все таксоны до рода включительно и все культивируемые виды[6], при этом таксоны, чьи представители известны в чистой культуре, вынесены на первое место:
- Класс Шаблон:Btname
- Порядок Шаблон:Btname
- Семейство Шаблон:Btname
- Род Шаблон:Btname
- Шаблон:Btname[7] и ещё 2 кандидата
- Род Candidatus NitrosocosmicusШаблон:Bt-aut (3 кандидата)
- Род Шаблон:Btname
- Семейство Шаблон:Btname
- Порядок Candidatus NitrosocaldalesШаблон:Bt-aut
- Семейство Candidatus NitrosocaldaceaeШаблон:Bt-aut
- Род Candidatus NitrosocaldusШаблон:Bt-aut (1 кандидат)
- Семейство Candidatus NitrosocaldaceaeШаблон:Bt-aut
- Порядок Шаблон:Btname
- Порядки incertae sedis
- Порядок Шаблон:Btname — в LPSN отнесён к типу Crenarchaeota
- Семейство Шаблон:Btname
- Порядок Шаблон:Btname
- Семейство Шаблон:Btname
- Род Шаблон:Btname
- Шаблон:Btname и ещё 5 кандидатов
- Род Candidatus NitrosoarchaeumШаблон:Bt-aut (2 кандидата)
- Род Candidatus Nitrosomarinus (1 кандидат)
- Род Шаблон:Btname
- Семейство Шаблон:Btname
- Роды incertae sedis
- Род Candidatus CaldiarchaeumШаблон:Bt-aut (1 кандидат)
- Род Candidatus GiganthaumaШаблон:Bt-aut (2 кандидата)
- Род Candidatus NitrosopelagicusШаблон:Bt-aut (1 кандидат)
- Род Candidatus NitrosotaleaШаблон:Bt-aut (1 кандидат)
- Род Candidatus NitrosotenuisШаблон:Bt-aut (2 кандидата)
- Порядок Шаблон:Btname — в LPSN отнесён к типу Crenarchaeota
Примечания