Competing endogenous RNAs (ceRNAs, also refer as miRNA sponges) hypothesis: ceRNAs regulate other RNA transcripts (e.g., PTEN) by competing for shared microRNAs.[1] They are playing important roles in developmental, physiological and pathological processes, such as cancer. Multiple classes of ncRNAs (lncRNAs, circRNAs, pseudogenes) and protein-coding mRNAs function as key ceRNAs (sponges) and to regulate the expression of mRNAs in plants and mammalian cells.[2]
This competing endogenous RNA (ceRNA) databases and resources is a compilation of databases and web portals and servers used for ceRNA prediction and ceRNA networks.
| Name
|
Description |
type |
References
|
| ceRNABase
|
ceRNABase is designed for decoding Pan-Cancer ceRNA networks involving lncRNAs and mRNAs by analyzing 5599 tumor and normal samples and 108 CLIP-Seq (HITS-CLIP, PAR-CLIP, iCLIP, CLASH) datasets. |
database and server |
[3]
|
| cefinder
|
Competing endogenous RNA database: predicted ceRNA candidates from genome. |
database |
[4]
|
| ceRNAFunction
|
ceRNAFunction is a web server to predict lncRNA and protein functions from pan-cancer ceRNA networks using 13 functional terms (including: GO, KEGG, BIOCARTA, etc.). |
webserver |
[3][5]
|
| Cupid
|
Cupid is a method for simultaneous prediction of miRNA-target interactions and their mediated competing endogenous RNA (ceRNA) interactions. It is an integrative approach significantly improves on miRNA-target prediction accuracy as assessed by both mRNA and protein level measurements in breast cancer cell lines. Cupid is implemented in 3 steps: Step 1: re-evaluate candidate miRNA binding sites in 3' UTRs. Step2: interactions are predicted by integrating information about selected sites and the statistical dependency between the expression profiles of miRNA and putative targets. Step 3: Cupid assesses whether inferred targets compete for predicted miRNA regulators. |
software (MATLAB) |
[6]
|
| Hermes
|
Hermes predicts ceRNA (competing endogenous RNA) interactions from expression profiles of candidate RNAs and their common miRNA regulators using conditional mutual information. |
software (MATLAB) |
[7]
|
| Linc2GO
|
a human LincRNA function annotation resource based on ceRNA webserver. |
database |
[8]
|
| .
|
References
Шаблон:Reflist
zh:CeRNA资源及数据库
| Партнерские ресурсы |
|---|
| Криптовалюты |
|
|---|
| Магазины |
|
|---|
| Хостинг |
|
|---|
| Разное |
- Викиум - Онлайн-тренажер для мозга
- Like Центр - Центр поддержки и развития предпринимательства.
- Gamersbay - лучший магазин по бустингу для World of Warcraft.
- Ноотропы OmniMind N°1 - Усиливает мозговую активность. Повышает мотивацию. Улучшает память.
- Санкт-Петербургская школа телевидения - это федеральная сеть образовательных центров, которая имеет филиалы в 37 городах России.
- Lingualeo.com — интерактивный онлайн-сервис для изучения и практики английского языка в увлекательной игровой форме.
- Junyschool (Джунискул) – международная школа программирования и дизайна для детей и подростков от 5 до 17 лет, где ученики осваивают компьютерную грамотность, развивают алгоритмическое и креативное мышление, изучают основы программирования и компьютерной графики, создают собственные проекты: игры, сайты, программы, приложения, анимации, 3D-модели, монтируют видео.
- Умназия - Интерактивные онлайн-курсы и тренажеры для развития мышления детей 6-13 лет
- SkillBox - это один из лидеров российского рынка онлайн-образования. Среди партнеров Skillbox ведущий разработчик сервисного дизайна AIC, медиа-компания Yoola, первое и самое крупное русскоязычное аналитическое агентство Tagline, онлайн-школа дизайна и иллюстрации Bang! Bang! Education, оператор PR-рынка PACO, студия рисования Draw&Go, агентство performance-маркетинга Ingate, scrum-студия Sibirix, имидж-лаборатория Персона.
- «Нетология» — это университет по подготовке и дополнительному обучению специалистов в области интернет-маркетинга, управления проектами и продуктами, дизайна, Data Science и разработки. В рамках Нетологии студенты получают ценные теоретические знания от лучших экспертов Рунета, выполняют практические задания на отработку полученных навыков, общаются с экспертами и единомышленниками. Познакомиться со всеми продуктами подробнее можно на сайте https://netology.ru, линейка курсов и профессий постоянно обновляется.
- StudyBay Brazil – это онлайн биржа для португалоговорящих студентов и авторов! Студент получает уникальную работу любого уровня сложности и больше свободного времени, в то время как у автора появляется дополнительный заработок и бесценный опыт.
- Автор24 — самая большая в России площадка по написанию учебных работ: контрольные и курсовые работы, дипломы, рефераты, решение задач, отчеты по практике, а так же любой другой вид работы. Сервис сотрудничает с более 70 000 авторов. Более 1 000 000 работ уже выполнено.
- StudyBay – это онлайн биржа для англоязычных студентов и авторов! Студент получает уникальную работу любого уровня сложности и больше свободного времени, в то время как у автора появляется дополнительный заработок и бесценный опыт.
|
|---|
