Русская Википедия:Аптамер

Материал из Онлайн справочника
Перейти к навигацииПерейти к поиску

Аптамеры — олигонуклеотидные или пептидные молекулы, специфически связывающиеся с определёнными молекулами-мишенями. Обычно аптамеры получают выбором из больших произвольных библиотек методом SELEX, но также существуют природные аптамеры в рибопереключателях. Они могут использоваться как для фундаментальных исследований, так и в медицинских приложениях (макромолекулярные лекарственные препараты, антивирусные препараты и т.д.).

Аптамеры могут быть использованы в следующих исследовательских, диагностических и терапевтических задачах[1]:

  1. Для детекции различных молекул-мишеней, как в научных, так и в диагностических задачах. Они могут заменить антитела в Вестерн-блоттинге, во флуоресцентной гибридизации in situ и в методе ELISA.
  2. Перспективным для диагностики форматом является создание чипов со множеством аптамеров и возможностью одновременной детекции многих белков.[2][3][4][5]
  3. Для аффинной очистки молекул-мишеней.
  4. Для эффективного и специфичного ингибирования белков-мишеней. Такое ингибирование может быть использовано как в исследовательских целях, так и для создания новых лекарств.[6][7] Некоторые такие лекарства уже находятся на стадии клинических испытаний.
  5. Перспективным направлением использования аптамеров является направленный транспорт лекарств. Аптамеры в этом случае определяют адресность доставки (targeting ligands).

ДНК-аптамеры

Пространственная структура ДНК-аптамеров чаще всего представлена G-квадруплексами из 2, реже 3, G-квартетов. Образование связи аптамера с молекулой-мишенью может быть осуществлено различными способами, например с помощью водородных связей между белком и водородами петель квадруплекса.

Были найдены и отобраны ДНК-аптамеры, способные с высокой аффинностью и специфичностью связываться с активным сайтом тромбина, таким образом препятствуя дальнейшей активации фибриногена и затормаживая каскад свертывания крови[8].

Примечания

Шаблон:Примечания

Литература

  1. Шаблон:Статья
  2. Gold, L., Ayers, D., Bertino, J., Bock, C., Bock, A., Brody, E., ... & Zichi, D. (2010). Aptamer-based multiplexed proteomic technology for biomarker discovery. PLoS ONE 5(12): e15004. Шаблон:PMID Шаблон:PMC Шаблон:DOI
  3. Moaddel, R., Ubaida‐Mohien, C., Tanaka, T., Lyashkov, A., Basisty, N., Schilling, B., ... & Ferrucci, L. (2021). Proteomics in aging research: A roadmap to clinical, translational research. Aging Cell, e13325. Шаблон:PMID Шаблон:PMC Шаблон:DOI
  4. Sebastiani, P., Federico, A., Morris, M., Gurinovich, A., Tanaka, T., Chandler, K. B., ... & Perls, T. T. (2021). Protein signatures of centenarians and their offspring suggest centenarians age slower than other humans. Aging cell, 20(2), e13290. Шаблон:PMID Шаблон:PMC Шаблон:DOI
  5. Sathyan, S., Ayers, E., Gao, T., Weiss, E. F., Milman, S., Verghese, J., & Barzilai, N. (2020). Plasma proteomic profile of age, health span, and all‐cause mortality in older adults. Aging cell, 19(11), e13250. Шаблон:PMID Шаблон:PMC Шаблон:DOI
  6. Yamagishi, S. I., & Matsui, T. (2018). Therapeutic potential of DNA-aptamers raised against AGE-RAGE axis in diabetes-related complications. Current pharmaceutical design, 24(24), 2802-2809. Шаблон:PMID Шаблон:DOI
  7. Sotokawauchi, A., Matsui, T., Higashimoto, Y., Nishino, Y., Koga, Y., Yagi, M., & Yamagishi, S. I. (2021). DNA aptamer raised against receptor for advanced glycation end products suppresses renal tubular damage and improves insulin resistance in diabetic mice. Diabetes and Vascular Disease Research, 18(1), 1479164121990533. Шаблон:PMID Шаблон:DOI
  8. Шаблон:Статья