Когда в 1347 году умер император Людвиг IV из династии Виттельсбахов, то сначала его пятеро сыновей правили его владениями совместно, а затем, по Ландсбергскому договору 1349 года, наследство было разделено. Стефан, Вильгельм и Альбрехт стали совместно править Нижней Баварией и Нидерландами. Четыре года спустя наследство было поделено далее, и по Регенсбургскому договору 1353 года Стефан получил новосозданное герцогство Бавария-Ландсхут. В 1363 году Стефан стал также и герцогом Верхней Баварии, которая в результате была присоединена к Баварии-Ландсхут.
После смерти Стефана три его сына правили герцогством совместно до 1392 года, когда оно было разделено вновь, выделив отдельные герцогства Бавария-Мюнхен и Бавария-Ингольштадт.
По решению императора в 1429 году оставшееся без правителя Баварско-Штраубингское герцогство было разделено на три части, одна из которых вошла в состав Баварско-Ландсхутского герцогства. В 1447 году к Баварии-Ландсхут было присоединено Баварско-Ингольштадтское герцогство.
В 1505 году после войны за ландсхутское наследство Баварско-Ландсхутское герцогство было разделено между Баварско-Мюнхенским герцогством и новосозданным герцогством Пфальц-Нойбург.
.JPG){kind=link}