Крещён был в селении Белалькасар в провинции Кордова. Время появления Белалькасара в Новом свете не установлено. С 1519 года он служил под начальством Педрариаса Давилы и в 1524 году покорил Никарагуа. Рассорившись с другими конкистадорами, в 1531 году он отплыл морем на помощь Франсиско Писарро и присоединился к его армии у берегов Перу.
Белалькасару было поручено завоевание северных владений инков на территории современного Эквадора. Разбив вождя инков, Белалькасар 6 декабря1534 году овладел индейской твердыней Кито.
Продолжая двигаться на север в поисках «золотого города» Эльдорадо, конкистадор объявил владением испанской короны долину реки Магдалена, где встретил проникшего туда ранее с севера Хименеса де Кесаду. После того, как король разграничил владения конкистадоров, Белалькасару пришлось удовольствоваться управлением провинции со столицей в Попаяне.
Последнее десятилетие жизни Белалькасара было омрачено новыми усобицами с конкистадорами. Его войска принимали участие в борьбе Писарро и Альмагро за главенство в Перу. Белалькасар в 1547 году получает просьбу о помощи от Педро де ла Гаска (нового губернатора), против восставшего Гонсало Писарро. С Белалькасаром вышел историк Сьеса де Леон из города Попаян.
Поскольку в 1546 году Белалькасар предал казни правителя соседней провинции, за это испанский суд приговорил его к смерти. Он собирался оспорить это решение перед королём, но умер в Картахене перед отплытием в Европу. Похоронен он был с большой помпой.
Память
Файл:10 сукре.jpg10 сукре 1983 год. Эквадор.Изображён на банкноте 10 сукре 1983 год. Эквадор.
P. Boyd-Bowman, Índice geo-biográfico de 56 mil pobladores de la América hispánica. I. 1493—1519. México, F.C.E., 1984, № 1339а.
Les conquistadors espagnols, par F.A. Kirkpatrick, Payot, Paris, 1935
Asselbergs, Florine G.L. (2004). Conquered Conquistadors: The Lienzo de Quauhquechollan, a Nahua vision of the conquest of Guatemala. CNWS publications series. Leiden, Netherlands: Research School CNWS. ISBN 978-90-5789-097-0.
