Сооружение глубоководного порта закончено в 1969 годусоветскими военными строителями. До гражданской войны в Сомали он использовался как советская военно-морская база, позже использовался американцами. В настоящее время используется в качестве торгового порта.
Морским путём связан с йеменскимАденом, находящимся в 255 км севернее. Автомобильными дорогами город соединён с сомалийскими континентальными городами Харгейса (150 км) и Буръо (120 км), а также со столицей соседней ЭфиопииАддис-Абеба (790 км).
Начиная с 1998 года, когда Эритрея закрыла для Эфиопии порт Асэб в результате Эритрейско-Эфиопской войны, порт Бербера является основным экспортно-импортным портом для Эфиопии, не имеющей собственного выхода к морю. Для непризнанного Сомалиленда это крупнейший источник поступления иностранной валюты.
В начале 1970-х годов СССР построил в городе крупнейшую взлётно-посадочную полосу для своей военно-морской авиации. Длина полосы — рекордная в Африке — 4140 метров. После изменения политической ситуации с началом войны за Огаден осенью 1977 года сотрудничество с СССР было закончено, и его место немедленно заняли США. Полоса перешла под управление американских военных и до распада Сомали в 1991 году была в списке резервных посадочных полос для американских космических Шаттлов.
В настоящий момент гражданские пассажирские полеты осуществляются авиакомпаниями из ОАЭ, Кении и Эфиопии.