Первая каменная церковь на Иерусалимском кладбище была построена на средства купца Михаила Сибирякова в 1793—1795 годах. 23 сентября 1820 года была заложена новая каменная Входо-Иерусалимская церковь. В 1830 году были закончены основные строительные работы (без внутренней отделки). 25 июля 1835 года церковь была освящена. В 1890 году к церкви с южной и северной сторон были пристроены два придела.
Архитектура церкви была необычна для культового строительства Иркутска и соответствовала тенденциям классицизма[1].
В 1931 году церковь была закрыта, в ней разместили училище культуры. В марте 2000 года здание было передано в ведение Иркутской епархии. 28 апреля 2013 года после восстановления храм был освящён[2].
Калинина И. В. Культовое православное зодчество // Памятники истории и культуры Иркутска. — Иркутск: Вост.-Сиб. кн. изд-во, 1993. — С. 403—405. — 448 с. — Тираж 5 000 экз. — ISBN 5-7424-0581-2
Калинина И. В. Православные храмы Иркутской епархии XVII — начало XX века: Научно-справочное издание. — М.: Галарт, 2000. — С. 115—117. — 496 с. — Тираж 5 000 экз. — Шаблон:ISBN с опечаткой