Берёт начало из озера Тана (Эфиопское нагорье) на высоте 1830 м. Сток из озера зарегулирован плотиной с гидроэлектростанцией. Голубой Нил судоходен на 580 км от устья.
Верхнее течение в пределах Эфиопского нагорья носит название Аббай. На протяжении 500 км течёт в каньоне глубиной 900—1200 м. В Эфиопии считается священной рекой, вытекающей из Эдема. В этой связи ей приносят дары в виде хлеба и других продуктов.
На территории Судана река носит название Бахр-эль-Азрак (от араб.бахр — «море» и азрак — «голубой»). На суданской территории сооружено крупное водохранилище у города Росейрес.
У города Хартум Голубой Нил сливается с Белым Нилом, образуя реку Нил.
В сезон дождей составляет 60 % стока Нила, в сухой сезон сильно мелеет. В нижнем течении используется для орошения полей хлопчатника и водоснабжения. Во влажный сезон средний расход воды 2350 м³/сек.
В 2011 году началось строительство «Великой Эфиопской плотины Возрождения», включающей в себя крупнейшую в Африке ГЭС из 16 радиально-осевых гидроагрегатов, суммарной установленной мощностью 6450 МВт[7][8][9]. Ввод в эксплуатацию первых гидроагрегатов и начало заполнения водохранилища запланирован на 2018 год[10]. Эфиопия начала заполнение водохранилища в начале июля 2020 года[11]
