Русская Википедия:Задача поиска изоморфного подграфа
Задача поиска изоморфного подграфа — это вычислительная задача, в которой входом являются два графа G и H и нужно определить, не содержит ли G подграф, изоморфный графу H. Задача поиска изоморфного подграфа является обобщением как задачи о максимальной клике, так и задачи о проверке, не содержит ли граф гамильтонов цикл, а потому является NP-полной[1]. Однако задачи поиска изоморфного подграфа с некоторыми видами подграфов могут быть решены за полиномиальное времяШаблон:SfnШаблон:Sfn.
Иногда также используется название сопоставление подграфа для той же задачи. Это название делает упор на поиске таких подграфов, а не просто на разрешимости.
Задача разрешимости и вычислительная сложность
Для доказательства, что задача поиска изоморфного подграфа NP-полна, её нужно сформулировать как задачу разрешимости. Входом задачи разрешимости служит пара графов G и H. Ответ задачи положителен, если H изоморфен некоторому подграфу графа G, и отрицателен в ином случае.
Формальное задание:
Пусть <math>G=(V,E)</math>, <math>H=(V^\prime,E^\prime)</math> — два графа. Существует ли подграф <math>G_0=(V_0,E_0): V_0\subseteq V, E_0\subseteq E\cap(V_0\times V_0)</math>, такой, что <math>G_0\cong H</math>? Т.е. существует ли отображение <math>f\colon V_0\rightarrow V^\prime</math>, такое, что <math>(v_1,v_2)\in E_0\Leftrightarrow (f(v_1),f(v_2))\in E^\prime</math>?
Доказательство NP-полноты задачи поиска изоморфного подграфа просто и основывается на сведении к этой задаче задачи о клике, NP-полной задачи разрешимости, в которой входом служит один граф G и число k, а вопрос состоит в следующем: содержит ли граф G полный подграф с k вершинами. Для сведения этой задачи к задаче поиска изоморфного подграфа, просто возьмём в качестве графа H полный граф Kk. Тогда ответ для задачи поиска изоморфного подграфа с входными графами G и H равен ответу для задачи о клике для графа G и числа k. Поскольку задача о клике NP-полна, такая полиномиальная сводимость показывает, что задача поиска изоморфного подграфа также NP-полнаШаблон:Sfn.
Альтернативное сведение от задачи о гамильтоновом цикле отображает граф G, который проверяется на гамильтоновость, на пару графов G и H, где H — цикл, имеющий то же число вершин, что и G. Поскольку задача о гамильтоновом цикле является NP-полной даже для планарных графов, это показывает, что задача поиска изоморфного подграфа остаётся NP-полной даже для планарного случаяШаблон:Sfn.
Задача поиска изоморфного подграфа является обобщением Шаблон:Не переведено 5, которая спрашивает, изоморфен ли граф G графу H — ответ для задачи об изоморфизме графов «да» тогда и только тогда, когда графы G и H имеют одно и то же число вершин и рёбер и задача поиска изоморфного подграфа для графов G и H даёт «да». Однако статус задачи изоморфизма графов с точки зрения теории сложности остаётся открытым.
ГрёгерШаблон:Sfn показал, что если выполнена гипотеза Аандераа — Карпа — Розенберга о Шаблон:Не переведено 5 монотонных свойств графа, то любая задача поиска изоморфного подграфа имеет сложность запроса Ω(n3/2). То есть решение задачи поиска изоморфного подграфа требует проверки существования или отсутствия во входе Ω(n3/2) различных рёбер графа[2].
Алгоритмы
УльманШаблон:Sfn описал рекурсивную процедуру с возвратом для решения задачи поиска изоморфного подграфа. Хотя время работы этого алгоритма, в общем случае, экспоненционально, он работает за полиномиальное время для любого фиксированного H (то есть время работы ограничено полиномом, зависящим от выбора H). Если G является планарным графом (или, более обще, Шаблон:Не переведено 5), а H фиксирован, время решения задачи поиска изоморфного подграфа может быть сокращено до линейного времениШаблон:SfnШаблон:Sfn.
УльманШаблон:Sfn существенно обновил алгоритм из статьи 1976-го года.
Приложения
Задача поиска изоморфного подграфа была применена в области хемоинформатики для поиска похожести химических соединений по их структурным формулам. Часто в этой области используется термин подструктурный поискШаблон:Sfn. Структура запроса часто определяется графически с использованием структурного редактора. Основанные на SMILES базы данных обычно определяют запросы с использованием Шаблон:Не переведено 5, расширения SMILES.
Тесно связанные задачи подсчёта числа изоморфных копий графа H в большем графе G используются для обнаружения шаблона в базах данныхШаблон:Sfn, в биоинформатике взаимодеийствия протеин-протеинШаблон:Sfn и в методах экспоненциальных случайных графов для математического моделирования социальных сетейШаблон:Sfn.
Ольрих, Эбелинг, Гитинг и СатерШаблон:Sfn описали приложение задачи поиска изоморфного подграфа в cистеме автоматизированного проектирования электронных схем. Задача сопоставления подграфа является также подшагом при преобразовании графа (требующего наибольшего времени выполнения), а потому предоставляется инструментальными средствами преобразования графа.
Задача также вызывает интерес в области искусственного интеллекта, где она считается частью группы задач сопоставления с образцом в графах. Также рассматривается в этой области расширение задачи поиска изоморфного графа, известное как Шаблон:Не переведено 5[3].
Примечания
Литература
- Шаблон:Книга
- Шаблон:Статья С середины 70-х известно, что задача поиска изоморфного подграфа разрешима в полиномиальное время для планарных графов. Однако, было замечено, что задача поиска подизоморфизма остаётся NP-полной, в частности, поскольку задача о гамильтоновом цикле является NP-полной для планарных графов.
- Шаблон:Книга
- Шаблон:Статья
- Шаблон:Книга. A1.4: GT48, стр.202.
- Шаблон:Статья.
- Шаблон:Книга.
- Шаблон:Книга
- Шаблон:Книга.
- Шаблон:Статья
- Шаблон:Статья
- Шаблон:Статья
- Шаблон:Книга.
- Шаблон:Статья
- ↑ В оригинальной статье Кука Шаблон:Harv, содержащей доказательство теоремы Кука — Левина, уже было показано, что задача поиска изоморфного подграфа NP-полна, путём сведения из задачи 3-SAT с использованием клик
- ↑ Здесь Ω — Омега большое.
- ↑ http://www.aaai.org/Papers/Symposia/Fall/2006/FS-06-02/FS06-02-007.pdf Шаблон:Wayback; expanded version at https://e-reports-ext.llnl.gov/pdf/332302.pdf Шаблон:Wayback