Во время повышения уровня моря 5,4-5,8 тыс. лет назад озеро Изменчивое, как и соседние протока Красноармейская и озеро Открытое, представляло собой один из трёх проливов, соединявших залив Тунайча с морем. В ходе дальнейшего повышения уровня моря лагуна 150—400 лет назад отделилась от озера
Тунайча. В настоящее время водоём является прибрежной лагуной, отчленённой от залива Мордвинова Охотского моря аккумулятивной косой[3].
Гидрография
Площадь зеркала 8,2 км², водосборная площадь — 12,9 км²[7]. Средняя глубина озера около 3 м, в северо-восточной части достигает 6 м. В северной части озера берега болотистые, имеются большие отмели. Побережье сложено из песка, гравия, гальки, иногда крупные камни, которые уже на небольшом удалении от берега сменяются чёрными илами[3].
Озеро Изменчивое сообщается с морем протокой шириной до 50 м и глубиной 5-10 м.
Иногда во время сильных и длительных штормов протока замывается, в результате изменяется состав животных и растительных сообществ озера. При прекращении водообмена с морем средняя температура воды в озере повышается на несколько градусов, а солёность понижается (до 25 ‰)[3].
Охрана природы
На территории озера создана лечебно-оздоровительная местность «с целью сохранения природных физических и химических свойств лечебных грязей озера, предохранения их от порчи, бактериального загрязнения и преждевременного истощения»[5].