История штата Миссури начинается с эпохи заселения территории штата человеком в эпоху палеоиндейцев около 12000 лет до нашей эры. В конце XVII века эта земля была открыта французским путешественником Жаком Маркеттом и стала частью французской колонии Новая Франция. В 1803 году Франция продала США все свои владения на Западе, и Миссури стало частью Территории Луизиана, которая в 1812 году была переименована в Территорию Миссури. В 1818 году Миссури подало запрос о присоединении к США, что привело к долгим спорам в Конгрессе и в итоге привело к соглашению, известному как Миссурийский компромисс. В 1821 году Миссури был принят в Союз в качестве 24-го штата. Штат быстро заселялся мигрантами из Германии и северных штатов, которые концентрировались в основном в городе Сент-Луис. В годы Гражданской войны штат контролировался Союзом, но на его территории произошло несколько сражений. Миссурийцы служили как в армии Юга, так и в армии Севера.
После войны к власти в штате пришли радикальные республиканцы, и только в 1875 году власть перешла к консерваторам, которые приняли новую конституцию. В штате строились новые железные дороги, развивалась промышленность и росли города.