Хамфри Маршалл родился 10 октября1722 года в семье Авраама и Мэри Хант Маршалл в районе современной деревни Маршалтон в округе Честер на территории Пенсильвании. Он был родственником Джона и Уильяма Бартрамов. В молодости работал каменотёсом. 16 сентября1748 года женился на Саре Пеннок, затем стал хозяином отцовской фермы в Пенсильвании. Под влиянием Бартрамов Хамфри заинтересовался ботаникой и астрономией, стал изучать местную древесную флору. В 1767 году Маршалл стал хозяином семейного поместья. В 1773 году он решил основать в Маршалтоне ботанический сад, второй в Америке после основанного Дж. Бартрамом. После его смерти, однако, этот сад был заброшен. В 1785 году Маршалл опубликовал книгу Arbustrum americanum — каталог известных ему американских видов кустарников и деревьев. В 1786 году Хамфри был избран членом Американского философского общества. В том же году умерла Сара Маршалл, через два года Хамфри женился на Маргарет Миншол. Через некоротое время зрение ботаника стало ухудшаться. В 1801 году он заболел дизентерией, 5 ноября 1801 года скончался.
