В Муйском районе 8 населённых пунктов.
Шаблон:Автонумерация
В 2004 году пгт Тоннельный был преобразован в сельский населённый пункт (посёлок), а в 2009 году упразднён.
Экономика
Перспективы района связаны с освоением минерально-сырьевых ресурсов.
В районе имеются:
В Муйском районе перевозки пассажиров осуществляются воздушным, автомобильным, железнодорожным и водным транспортом. Железные дороги района представлены сетью железных дорог общего пользования и промышленным железнодорожным транспортом. По территории района проходит Байкало-Амурская магистраль.
Достопримечательности
Источники минеральных вод в районах рек Верхней Ангары, Ангаракана, Муи.
Высшая точка Южно-Муйского хребта гора Спартак (пик Муйский гигант). Это вторая по высоте вершина Забайкалья — 3067 м.
Файл:Иркутская пещера.jpgПетроглифы бронзового векаПещера Иркутская — ритуальная пещера древних таежных племен, предков эвенков. Расположена в 18 км к северо-западу от п. Таксимо, в полутора километрах от автодороги Таксимо-Бодайбо на правом крутом, около 35гр., берегу р. Аикта. На стенах привходового грота пещеры изображены петроглифы бронзового века, среди которых — три рогатых шамана. Эти писаницы своеобразны и не имеют аналогов в Восточной Сибири.
Плато Золотое на Северо-Муйском хребте — плато в 30 км от посёлка Таксимо по автодороге Таксимо-Бодайбо. Находится на отметке выше 2000 м. На плато имеются пещеры, предположительно, глубиною до 700 м. Одна из них была открыта русско-французской экспедицией спелеоклуба «Арабика» в 1994 г.
Усть-Бамбуйка и Усть-Тулдунь — неолитические стоянки эпохи раннего железного века и неолита.