Русская Википедия:ПЦР с обратной транскрипцией

Материал из Онлайн справочника
Перейти к навигацииПерейти к поиску

Шаблон:Redirect

Файл:Reverse transcription polymerase chain reaction.jpg
ОТ-ПЦР

В молекулярной биологии метод полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (Шаблон:Lang-en) принято обозначать как ОТ-ПЦР (Шаблон:Lang-en). ОТ-ПЦР представляет собой метод амплификации специфического фрагмента рибонуклеиновой кислоты (РНК).[1]

Одноцепочечную молекулу РНК превращают в реакции обратной транскрипции (ОТ, Шаблон:Lang-en) в комплементарную ДНК (cDNA) и далее амплифицируют уже одноцепочечную молекулу ДНК, используя традиционную ПЦР. RT-PCR не следует путать с ПЦР в реальном времени (Шаблон:Lang-en), которую также иногда неверно сокращают как RT-PCR.[2]

Описание метода

Для превращения последовательности РНК в комплементарную ДНК используют обратную транскриптазу:

  • 1. Реакция первой цепочки:
    Комплементарная ДНК (cDNA) образуется на матрице мРНК из dNTP ферментом обратной транскриптазой. Компоненты реакции смешиваются с ДНК-праймером и буфером с обратной транскриптазой на один час при 37 °C.
  • 2. Реакция второй цепочки:
    После того как обратная транскрипция закончена и образована cDNA на матрице мРНК, следующие циклы производятся по стандартной методике ПЦР.

После 30 циклов амплификации образуются миллионы копий нужной последовательности.[2]

Применение

ОТ-ПЦР используется для обнаружения молекул РНК в образце с заранее известным участком последовательности, комплементарным праймеру. Экспоненциальная амплификация при помощи ОТ-ПЦР является чувствительной методикой, с помощью которой может быть обнаружено малое количество молекул РНК.

Примером являются РНК-вирусы, такие как вирус иммунодефицита человека (ВИЧ), который является ретровирусом и поэтому использует фермент обратную транскриптазу ВИЧ (Шаблон:Lang-en) для синтеза вирусной ДНК, которая затем встраивается в геном хозяина.

Также ОТ-ПЦР широко используется для диагностики генетических заболеваний и полуколичественного определения специфических молекул РНК в клетке или ткани как индикатор экспрессии соответствующих генов[3].

См. также

Примечания

Шаблон:Примечания

Литература

Шаблон:Перевести

Внешние ссылки

Шаблон:Выбор языка Шаблон:Mol bio-stub