Клуб был основан в 1967 году в Тегеране при финансовой поддержке Iran Khodro, и назван в честь автомобиля Пейкан[1] (Пейкан означает «стрела» на фарси), выпускаемого данным заводом. Основная задача клуба была в продвижении продукта автозавода и улучшения его репутации. На тот момент клуб мог позволить себе лучших игроков иранской лиги. В 1969 году команда стала чемпионом Тегеранской городской Лиги, и у команды появилось светлое будущее. Но в 1970 после серии разногласий между игроками и руководством футбольную команду распустили. Несмотря на это клуб продолжал существовать специализируясь на баскетболе, волейболе и гандболе.
Лишь 30 лет спустя в 2000 году в клубе вновь появилась футбольная команда. Были куплены акции клуба «Бахман» из города Кередж. «Пайкан» сохранил игроков «Бахмана», но назначил своего тренера. По окончании сезона 2004/05 команда выбыла во второй дивизион. Но по прошествии одного года вновь вернулась в элиту. Клуб ещё три раза вылетал во вторую лигу, каждый раз проводя в ней один сезон, а затем возвращался в элиту.
В 2008 году «Пайкан» был переведен в город Казвин, потому что в Тегеране было много футбольных команд с низкими показателями посещаемости.
В 2013 году клуб вернулся в Тегеран и продолжил выступление на отремонтированном стадионе «Тахти Тегеран». Но уже через год клуб вновь переезжает. На этот раз в город Годс, где и базируется до настоящего времени.
Домашние матчи «Пайкан» проводит на стадионе «Шахр-и Годс» вмещающем 25000 зрителей.
