Верховья Пекоса находятся на южных склонах гор Сангре-де-Кристо в живописных горных ущельях. Участок верхнего течения реки длиной 33 км (20,5 миль) от истока до посёлка Террерро 6 июня 1990 года получил статус «Дикой и живописной реки» (Шаблон:Lang-en)[4].
Ниже по течению находится историческая область проживания коренных обитателей Северной Америки, центр которой посёлок Пекос. Рядом с ним расположен национальный исторический парк «Пекос».
В районе посёлка Вильянуэва расположен природный парк штата с живописными ущельями. В самом посёлке в долине течение реки спокойное.Шаблон:Нет АИ
Средняя часть Пекоса протекает по плоскогорью Ллано-Эстакадо. Пекос играет большую роль в экономике и жизни большого района, к этому источнику воды, дефицитной во всей восточной части штата, тяготеют сельскохозяйственные производства и населённые пункты. На реке расположены Санта-Роза, Форт-Самнер, Розуэлл, Артезиа, Карлсбад, Пекос. Вдоль реки происходило постепенное заселение региона испанцами.Шаблон:Нет АИ
На реке построено несколько дамб и водохранилищ. Наиболее известна ирригационная система в районе Карлсбада, созданная в начале XX века, с дамбами Авалон и Мак-Миллан. Система позволяет орошать более 10 тысяч гектаров сельскохозяйственных земель. Большое водохранилище Санта-Роза находится вблизи одноимённого посёлка. Водохранилище Ред-Блафф на границе штатов Нью-Мексико и Техас является самой низкой точкой Нью-Мексико.Шаблон:Нет АИ
