Пограничная охрана была сформирована в 1992 года (в ходе создания вооружённых сил страны), в её распоряжении оказались часть объектов и имущества Закавказского пограничного округапограничных войск СССР (официально расформированного 15 марта 1993 года).
30 сентября 1992 года Россия подписала с Арменией договор «О статусе пограничных войск РФ, находящихся на территории Армении и условиях их функционирования», согласно которому охрана государственной границы Армении с Турцией (участок в 330 километров) и Ираном (45 километров) должна осуществляться пограничными войсками России. Данная система охраны указанных участков границы, полностью сохранилась с советского периода[1].
26 апреля 1994 года парламент Армении принял закон о государственной границе. С 2020 года руководителем пограничных войск Армении является полковник Арман Максимович Маралчян.
Армянские пограничники охраняют армяно-грузинскую и армяно-азербайджанскую границы. Армяно-турецкую и армяно-иранскую границу охраняют четыре погранотряда специального управления ФСБ России в Армении.
В 2016 году на вооружении пограничной охраны имелось 5 БМД-1, 44 БМП-1, 1 БМП-1К, 5 БРМ-1К, 24 бронетранспортёра (БТР-70, БТР-60 и БТР-152)[2], а также автомобильная техника.
