Река берёт начало на западных склонах Северного Урала. Исток находится севернее вершины Мирон-Ван-Нёр (977 м НУМ), лежит на водоразделе с бассейном Щугора. Первые километры течёт в горной местности, течение бурное, делает большую петлю, огибая гору Редка[2].
В среднем течении река выходит на предгорья Урала, течение чуть замедляется. Генеральное направление течения — северо-запад. В среднем и нижнем течении река образует многочисленные острова и протоки. Всё течение реки проходит по ненаселённой холмистой тайге, кроме села Подчерье в устье реки других населённых пунктов на берегах нет. Встречаются избы, которые используют туристы, рыбаки и охотники, у устья реки Орловка одноимённая покинутая деревня[3].
Берега реки в основном поросли густым лесом (ель, пихта, береза и кедр), встречаются скалистые выходы. В русле много каменистых перекатов и порожков, перекаты чередуются с плёсами[3].
В районе впадения Подчеремвожа ширина реки составляет около 25 метров, скорость течения 0,7 м/с. У устья реки Малая Емель Подчерье расширяется до 70-90 м, скорость течения 0,6 м/с[4]. Впадает в Печору в селе Подчерье.
Питание снеговое и дождевое. Замерзает в начале ноября, вскрывается в мае.
