Сегура обычно находится в состоянии засухи, однако, время от времени, на реке случаются наводнения из-за проливных дождей, которые случаются раз в 6-9 лет, всегда осенью.
Ср. расход воды
Место
Расход
Сенахо
17,1 м³/с
Сьеса
26,3 м³/с
Ориуэла
5 м³/с
Гвардамар-дель-Сегура
1 м³/с
В двадцатом веке значительные наводнения случались в 1946, 1948, 1973, 1982, 1987 и 1989. С 1990 в нижнем течении реки были прорыты каналы, срезающие излучины и улучшающие таким образом отвод паводковых вод. В сентябре 1997 и октябре 2000 был опробован новый канал, когда проливные дожди вызвали значительное повышение уровня воды.
Паводки на Сегуре в Мурсии и Ориуэле
Дата
Мурсия
Ориуэла
октябрь 1651
1.700 м³/с
октябрь 1834
1.000 м³/с
октябрь 1879
1.890 м³/с
апрель 1946
1.187 м³/с
1.138 м³/с
октябрь 1948
934 м³/с
1.172 м³/с
ноябрь 1987
1.000 м³/с
Аллювиальная равнина реки называется здесь Вега-дель-Сегура, это плодородный сельскохозяйственный район, где выращивают разнообразные овощи, фрукты и цветы. Вегас делится на три площади: Альта, Медиа и Баха (верхняя, средняя и нижняя).
Раньше Сегура была одной из самых загрязнённых рек в Европе. Тем не менее, в последние годы ситуацию значительно улучшили экстенсивные методы управления ресурсами реки и введение в эксплуатацию водоочистных систем.