Русская Википедия:Сродство (биохимия)

Материал из Онлайн справочника
Перейти к навигацииПерейти к поиску

В биохимии cродство (также аффинность связывания) является мерой тенденции молекул к связыванию с другими молекулами, например между партнерами по связыванию при взаимодействии белок-лиганд: чем выше аффинность, тем больше константа ассоциации Ka (также называемая константой связывания).

Характеристики

Однако в настоящее время вместо константы ассоциации обычно используют обратную меру — константу диссоциации Kd : чем выше сродство белка к своему лиганду, тем ниже константа диссоциации комплекса. На примере образования/расщепления фермент-субстратного комплекса [ЭС].

Enzym-Substrat-Wechselwirkung

определения согласно закону действующих масс или кинетическим константам (константам скорости k) перечислены здесь:

константа ассоциации(константа связывания) <math> K_a = {[ES] \over [E] \cdot [S] } </math> <math> K_a = {k_1 \over k'_1 } </math>
константа диссоциации <math> K_d = {[E] \cdot [S] \over [ES]} </math> <math> K_d = {k'_1 \over k_1} </math> .

В кинетике ферментов Km, константа Михаэлиса, иногда используется как мера сродства фермента к его субстрату. На практике это имеет определённое право, но теоретически константу диссоциации ЭС-комплекса Kd и константу Михаэлиса необходимо строго различать. Согласно Бриггсу и Холдейну, постоянная Михаэлиса также зависит от числа изменений k2 и рассчитывается следующим образом:

<math> K_m = {k'_1 + k_{2} \over k_1} </math> .

Вывод из Km в Kd возможен только в том случае, если <math>k_2 \ll k'_1</math> . Это предположение подходит не во всех случаях, но первоначально было сделано Леонор Михаэлис и Мод Ментен для вывода уравнения Михаэлиса-Ментен.

Аффинность можно определить с помощью анализа связывания лиганда.

См. также

Литература

  • Джереми М. Берг, Джон Л. Тимочко, Люберт Страйер : биохимия. 6-е издание, академическое издательство «Спектр», Гейдельберг, 2007 г. ISBN 978-3-8274-1800-5 .
  • Дональд Воет, Джудит Г. Воет: Биохимия. 3. Издание, John Wiley & Sons, Нью-Йорк, 2004 г. ISBN 0-471-19350-X .
  • Брюс Альбертс, Александр Джонсон, Питер Уолтер, Джулиан Льюис, Мартин Рафф, Кит Робертс: Молекулярная биология клетки, 5. Издание, Тейлор и Фрэнсис, 2007 г., ISBN 978-0-8153-4106-2 .