Современный речной порт Термеза был открыт в советский период, а точнее в 1953 году. До этого периода, в Термезе также существовал порт. Современное устройство порт имеет с 1994 года. Площадь территории порта в начале 2000-х годов составлял свыше 20 га. По данным Национальной энциклопедии Узбекистана, имеет несколько крупных крытых и открытых ангаров и амбаров, где вмещаются грузы от 10 до 100 тыс. тонн. Имеет несколько портовых кранов. Порт обслуживают десятки теплоходов, барж, катеров и другие виды водного транспорта. В начале 2000-х годов, годовой грузопоток порта составлял примерно 600-900 тысяч тонн. Так как порт находится у трансграничной реки Амударья, которая является границей между Республикой Узбекистан и Исламской Республикой Афганистан, порт хорошо охраняется пограничниками Узбекистана из-за возможной опасности от террористов на территории соседнего Афганистана. В нескольких километрах к востоку от порта расположен трансграничный «Мост Дружбы» над Амударьёй, который соединяет узбекистанский Термез с афганским Хайратоном.
Во время неспокойной обстановки в Афганистане порт имел достаточно низкий грузопоток с Афганистаном. Но в последние годы из-за относительного мира на севере Афганистана и улучшения отношений между Узбекистаном и Афганистаном, порт стал играть важную роль в экспорте и импорте товаров из одной страны в другую и обратно.