Русская Википедия:Цветовая схема моделей Кори — Полинга — Колтуна
В химии, раскраска по CPK (Шаблон:Lang-en, Шаблон:Lang-ru) — популярная схема цветового обозначения атомов различных химических элементов в молекулярных моделях. Данная схема названа в честь молекулярной модели CPK, созданной Робертом Кори и Лайнусом Полингом и усовершенствованной Уолтером Колтуном.
История
В 1952 году, Кори и Полинг опубликовали описание объёмной модели белков и других биомолекул, которую они создали в Калифорнийском технологическом институте.[1] Их модель представляла атомы деревянными шариками, раскрашенными в яркие цвета, соответствующие химическим элементам. Их цветовая модель включала:
Они также построили уменьшенные модели, используя пластиковые шарики такой же цветовой схемы.
В 1965 году Колтун запатентовал улучшенную версию модели Кори-Полинга.[2] В своём патенте он упоминает следующие цвета:
- белый для водорода
- чёрный для углерода
- синий для азота
- красный для кислорода
- тёмно-жёлтый для серы
- пурпурный для фосфора
- оттенки от светло- до тёмно-зелёного соответственно для галогенов (F, Cl, Br, I)
- серебряный для металлов (Co, Fe, Ni, Cu)
Типичные цветовые обозначения
Типичные цветовые обозначения в CPK включают:
| Шаблон:Colorbox | водород (H) | белый |
| Шаблон:Colorbox | углерод (C) | чёрный |
| Шаблон:Colorbox | азот (N) | синий |
| Шаблон:Colorbox | кислород (O) | красный |
| Шаблон:Colorbox | фтор (F), хлор (Cl) | зелёный |
| Шаблон:Colorbox | бром (Br) | тёмно-красный |
| Шаблон:Colorbox | иод (I) | тёмно-фиолетовый |
| Шаблон:Colorbox | благородные газы (He, Ne, Ar, Xe, Kr) | циановый |
| Шаблон:Colorbox | фосфор (P) | оранжевый |
| Шаблон:Colorbox | сера (S) | жёлтый |
| Шаблон:Colorbox | бор (B), большинство переходных металлов | бежевый |
| Шаблон:Colorbox | щелочные металлы (Li, Na, K, Rb, Cs) | фиолетовый |
| Шаблон:Colorbox | щелочноземельные металлы (Be, Mg, Ca, Sr, Ba, Ra) | тёмно-зелёный |
| Шаблон:Colorbox | титан (Ti) | серый |
| Шаблон:Colorbox | железо (Fe) | темно-оранжевый |
| Шаблон:Colorbox | другие элементы | розовый |
Некоторые из цветов CPK мнемонически связаны с цветами чистых элементов или их соединений. Например, водород — бесцветный газ, углерод в виде угля или графита чёрный, многие формы серы имеют жёлтый цвет, хлор — зеленоватый газ, бром — тёмно-красная жидкость, иод в эфире фиолетовый, одна из аллотропных модификаций фосфора имеет красный цвет, железная ржавчина имеет тёмно-оранжевый оттенок, и т. д. В случае других элементов, таких как кислород и азот, выбор цвета менее понятен. Вероятно, красный цвет для кислорода был выбран потому что он часто ассоциируется с горением, а голубой цвет для азота обусловлен тем, что это главный компонент земной атмосферы, имеющей голубой оттенок.
Современные варианты
Следующая таблица представляет собой цвета, назначаемые каждому элементу в популярных компьютерных программах. Колонка C содержит изначальные цвета Кори и Полинга,[1] колонка K содержит цвета из патента Колтуна.[2] Колонка J описывает цветовую схему, используемую молекулярным визуализатором Jmol.[3] Колонка R описывает цветовую схему, используемую программой RasMol; в случае если указаны два цвета, второй актуален для версий 2.7.3 и выше.[3][4] Все цвета даны приблизительно и могут зависеть от дисплея и настроек видео.
Примечания
Ссылки
- What is the basis for the CPK color scheme? Which colors is used for which atom?
- Physical Molecular Models
- Модель Кори-Полинга-Колтуна: стандарт «молекулярного конструктора»
- ↑ 1,0 1,1 Robert B. Corey and Linus Pauling (1953): Molecular Models of Amino Acids, Peptides, and Proteins. Review of Scientific Instruments, Volume 24, Issue 8, pp. 621—627. Шаблон:Doi
- ↑ 2,0 2,1 Walter L. Koltun (9165), Space filling atomic units and connectors for molecular models. U. S. Patent 3170246.
- ↑ 3,0 3,1 Jmol color table на sourceforge.net.
- ↑ Rasmol color table Шаблон:Webarchive на bio.cmu.edu.
