Существует несколько версий происхождения гидронима Цон.
Этнограф Павел Якоби в книге «Вятичи Орловской губернии» обосновывал финское происхождение:
Шаблон:Начало цитаты
В Орловском уезде есть река Цон (родит. падеж: Цона и Цна); имя это я выше поставил в связь с именем двух мордовских рек имени Цна, и третей финской реки Вышневолоцкой системы. Но в Писцовой книге Орловского уезда в самом конце XVI века река Цон назывался Оцна, то есть принадлежащая к Оке, или производная форма от Оки <…> а утратив оголовное О, Оцна обратилась в Цон и Цна, имя нескольких рек финского края.
Шаблон:Конец цитаты
На самом деле в Писцовых книгах Орловского уезда XVI века встречаются две формы написания названия реки Цон: «на Оцне»[2] и «за Оцномъ»[3], − из чего можно сделать вывод, что в XVI веке река могла называться Оцон.
Тем не менее, название Цон близко к популярному в западной России гидрониму Цна, который, возможно, произошёл от общеславянского гидронима Десна. Река Цон, так же как все реки именуемые Цна и Десна, является правым (Шаблон:Lang-orv — «правый») притоком при движении от устья к истоку (в настоящее время понятие «левых» и «правых» притоков рассматривается при движении от истока к устью). Основываясь на этом правиле именования притоков можно предположить, что название реки Цон произошло от гидронима Десна прямо или через гидроним Цна.
Существуют также примеры народной этимологии, связывающие название реки с именем убийцы графа Каменского Оцона Ивановича, и со словами Сон, Чудесная.[4]