Представитель польско-литовского княжеского рода Чарторыйских. Старший сын князя Адама Людвика Чарторыйского (1872—1937), 1-го ордината на Синяве (1894—1937), и графини Марии Людвики Красинской (1883—1958).
В 1937 году после смерти своего отца Августин Юзеф Чарторыйский унаследовал Музей Чарторыйских в Кракове и Синявскую ординацию.
Перед началом Второй Мировой войны самые ценные предметы были вывезены из Музея Чарторыйских в Синявский дворец и замурованы. Остальные экспонаты были перемещены вниз, в подвал музея. Когда в сентябре немцы стали бомбить Краков, князь Августин и княгиня Долорес, которая тогда была беременна, покинули Синяву. 18 сентября немецкие войска заняли и разграбили Синявский дворец. Августин и Долорес были арестованы Гестапо. После тяжелых переговоров и при содействии испанских и итальянских родственников они были депортированы и в конце 1939 года прибыли в Испанию. Во время своего изгнания в Испании князь Августин активно сотрудничал с польским сопротивлением, но его слабое здоровье и отчаяние сказались на его жизни.
1 июля 1946 года 38-летний князь Августин Юзеф Чарторыйский скончался в Севилье, где и был похоронен.
