В ходе археологических разведывательных работ, проведённых в Шемокмеди с 1991 по 1994 год, были обнаружены фрагменты керамики, характерные для Куро-араксской культуры, что может означать, что район села уже был заселён в раннем бронзовом векеШаблон:Sfn.
Задокументированная история Шемокмеди неразрывно связана с монастырским комплексом, расположенным на небольшом холме, возвышающемся над деревней. Монастырь был основан родом Гуриели, правившим Гурийским княжеством. В XV веке он служил резиденцией грузинского православного митрополита-епископа, а также кладовой для церковных сокровищ, где к концу XIX века была собрана обширная коллекция различных предметов из других грузинских монастырей. В то время село было хорошо укреплено, в нём находился замок, принадлежавший ГуриелиШаблон:Sfn.
Во время восстания 1819—1820 годов в Имеретии и Гурии против русского владычества замок Шемокмеди, находившийся тогда во владении князя Кайхосро IV Гуриели, стал главным оплотом повстанцев в Гурии. Именно там в апреле 1820 года гурийцы казнили захваченного в плен полковника Пузыревского, русского временного губернатора Имеретии, и пресекли попытку русских карательных сил напасть на крепостьШаблон:Sfn. 24 июля 1820 года русский генерал Алексей Вельяминов взял штурмом и захватил Шемокмеди. Замок, названный русскими чиновниками «обителью разбоя», был в отместку разрушен до основания. Все дома были сожжены, а сельскохозяйственные угодья и виноградники уничтожены, чтобы наказать местных жителей пребыванием в «крайней нищете»Шаблон:SfnШаблон:Sfn.
Население
По данным национальной переписи населения 2014 года, население Шемокмеди составляло 1322 человека[1]. Абсолютное большинство из них (99,5 %) - этнические грузины[1].