20 декабря 1792 года вступил добровольцем в 7-й батальон волонтёров департамента Од, 15 февраля 1793 года выбран старшим сержантом, 24 апреля избран сослуживцами капитаном 4-й свободной роты Ода, которая влилась в состав 1-й полубригады лёгкой пехоты. 5 августа 1793 года по рекомендации генерала Флера молодой Эмар переведён в штаб Армии Восточных Пиренеев, 17 сентября был ранен в сражении при Пейресторте в Каталонии. После гибели генерала Лагарпа, 8 мая 1796 года зачислен в ряды 17-й полубригады лёгкой пехоты, с которым сражался в Италии вплоть до Люневильского мира. При Лоди во главе своей роты он отбросил австрийских гусар, и захватил на Адде три лодки загруженные провизией. 5 августа при Кастильоне захватил две пушки и гаубицу. При Риволи во главе 50 солдат был окружён превосходящим врагом, умело вёл активную оборону, используя поваленные деревья, защищал позицию до подхода подкреплений. При Бормиде с двумя ротами охватил левый фланг противника, и при помощи егерей захватил 80 пленных. При Нови получил сквозное пулевое ранение.
20 августа 1804 года — командир батальона 8-го полка линейной пехоты, участвовал в кампаниях 1805 и 1806 годов в составе дивизииРиво1-го корпуса. 23 февраля 1807 года произведён в полковники и назначен командиром 32-го полка линейной пехоты в составе дивизииДюпона, во главе которого отличился в сражении 14 июня 1807 года при Фридланде.
После заключения Тильзитского мира вместе с полком направлен в Испанию, где и сражался с 1808 по 1812 годы. 28 июля 1809 года в сражении при Талавере нанёс поражение 2-й бригаде английской гвардии, был тяжело ранен и награждён королём Жозефом почётным крестом с алмазами, участвовал в захвате Мадрида. 4 ноября 1810 года при переходе через Рио-Альмангору два батальона 32-го линейного полка под командованием Эмара и три полка кавалерии генерала Мийо опрокинули испанскую армию, захватили всю артиллерию и больше пленных, чем было самих атакующих.
В начале апреля 1813 года возвратился во Францию, 12 апреля 1813 года — бригадный генерал, принимал участие в Саксонской кампании, 13 июля 1813 года — командир 2-й бригады 5-й пехотной дивизии 9-го корпусаВеликой Армии, 6 августа переведён в состав 4-й дивизии Императорской гвардии, 10 октября 1813 года отличился в сражении при Наумбурге, где смог отразить сильные атаки противника, ранен при Лейпциге, 30 декабря 1813 года — командир 1-й бригады 6-й дивизии Молодой гвардии. В 1814 году сражался в Бельгии, заслужил доверие Лазара Карно, губернатора Антверпена. Во главе своего небольшого отряда (1200 солдат Молодой гвардии, эскадрон Красных улан, два орудия) очистил страну от неприятеля, отличился в сражении при Куртре, где полностью разгромил интервентов.
При первой реставрации Бурбонов был назначен 1 октября 1814 года командующим департамента Эро, во время «Ста дней» вновь присоединился к Императору и 22 апреля 1815 года возглавил 1-ю бригаду Императорской гвардии, занимался организацией новых полков в Суасоне, где его застала новость о разгроме при Ватерлоо. При второй реставрации вышел 1 января 1816 года в отставку, после Июльской революции 1830 года возвратился на службу и был назначен 29 ноября 1830 года командующим департамента Рона, 4 декабря 1830 года — командир 1-й суб-дивизии в Воклюзе, 30 сентября 1832 года произведён в генерал-лейтенанты. Во время беспорядков в Лионе в 1830—34 годах командовал 7-м военным округом и суровыми методами восстановил власть закона, за что 30 сентября 1834 года награждён достоинством пэра Франции, 31 мая 1848 года определён в резерв.
