Долгое время на этих землях не было китайских административных структур, они управлялись местными вождями (тусы). Лишь во времена империи Цин был взят курс на интеграцию племён в общеимперскую структуру, и в 1736 году была создана Шинаньская управа (施南府) и подчинённые её властям 6 уездов. После Синьхайской революции в Китае была проведена реформа структуры административного деления, и в 1912 году управы были упразднены.
Во время Второй мировой войны, после того, как японцы взяли Ухань, в 1939 году гоминьдановские власти провинции Хубэй переехали в уезд Эньши, и оставались там вплоть до окончания войны.
После образования КНР в 1949 году был образован Специальный район Эньши (恩施专区), в который вошло 8 уездов. В 1970 году Специальный район Эньши был переименован в Округ Эньши (恩施地区).
В 1979 году уезд Лайфэн был преобразован в Лайфэн-Туцзяский автономный уезд.
В 1980 году уезд Хэфэн был преобразован в Хэфэн-Туцзяский автономный уезд.
В 1981 году из уезда Эньши был выделен городской уезд Эньши (恩施市).
Постановлением Госсовета КНР от 19 августа 1983 года был ликвидирован округ Эньши, а вместо него был создан Эси-Туцзя-Мяоский автономный округ (鄂西土家族苗族自治州); Хэфэн-Туцзяский автономный уезд и Лайфэн-Туцзяский автономный уезд были при этом преобразованы в уезды Хэфэн и Лайфэн, а уезд Эньши присоединён к городскому уезду Эньши.
В 1986 году уезд Личуань был преобразован в городской уезд.
В 1993 году Эси-Туцзя-Мяоский автономный округ был переименован в Эньши-Туцзя-Мяоский автономный округ.
Административно-территориальное деление
Эньши-Туцзя-Мяоский автономный округ делится на 2 городских уезда и 6 уездов:
