Журнал непрерывно издается с момента его создания в 1818 году профессором биохимии Йельского университетаБенджамином Силлиманом, который, на первых порах, сам издавал, редактировал и финансировал его[1].
С 1815 года Бенджамин Силлиман являлся членом Американской академии искусств и наук[2] и, видимо поэтому, до 1880 года издание также называли «Американский журнал науки и искусства», но его внимание всегда уделялось естественным наукам, особенно геологии и смежным предметам, хотя и в понятной большинству читателей форме. Журнал выходил на английском языке.[3].
В первые годы журнал часто называли «Журналом Силлимана», и публикации стали больше ассоциироваться с Йельским университетом из-за длительного пребывания редакции в стенах последнего (по 1853 год). Должность редактора долгое время оставалась в семье профессора Силлимана, поскольку с 1838 года ему помогал его сын Шаблон:Iw. После смерти старшего Силлимана в 1864 году его сменил на посту главного редактора его зять-натуралист Джеймс Дуайт Дана[4], а затем с 1895 по 1926 год сын последнего Шаблон:Iw[5]. Среди помощников редактора были ботаник Эйса Грей и зоолог Луи Агассис. В журнале печатали свои статьи и российские учёные, например, Д. К. Бобылёв, в будущем один из авторов «ЭСБЕ»[6].
