Шаблон:Short description
Шаблон:Refimprove
Horizontal correlation is a methodology for gene sequence analysis. Rather than referring to one specific technique, horizontal correlation instead encompasses a variety of approaches to sequence analysis that are unified by two specific themes:
- Sequence analysis is performed by making comparisons horizontally, along the length of a single genetic sequence; this is in contrast to vertical methods that make comparisons across several different genetic sequences.
- The comparisons made generally measure information theoretic quantities such as value of the mutual information function between two regions of the sequence.
The core ideas of the horizontal correlation approach were first presented in a year 2000 paper by Grosse, Herzel, Buldyrev, and Stanley (Grosse, et al. 2000). In this first formulation, Grosse and colleagues sought to characterize a large genetic sequence by dividing the sequence into coding and non-coding regions. Whereas traditional approaches to the coding-vs.-non-coding problem generally relied on sophisticated pattern recognition systems that were first trained on small inputs and then run over the entire sequence (Ohler, et al. 1999), the horizontal correlation approach of Grosse and colleagues worked instead by breaking the sequence into many relatively short sequence fragments, each only 500 base pairs in length. They then sought to characterize each of these fragments as either coding or non-coding. This was accomplished by comparing each size 3 window along the length of a fragment with the first size 3 window in that fragment, then measuring the value of the mutual information function between the two windows. Coding sequences were found to display a stylized pattern of 3-periodicity that non-coding sequences did not. Such a pattern was easy to recognize, and enabled significantly more rapid, more species-independent identification of coding regions (Grosse, et al. 2000).
Since 2000, horizontal correlation methodologies emphasizing the measurement of information theoretic quantities along the length of a gene sequence have been put to widespread use, and have even found application in shotgun sequencing fragment assembly (Otu & Sayood, 2004).
References
Партнерские ресурсы |
---|
Криптовалюты |
|
---|
Магазины |
|
---|
Хостинг |
|
---|
Разное |
- Викиум - Онлайн-тренажер для мозга
- Like Центр - Центр поддержки и развития предпринимательства.
- Gamersbay - лучший магазин по бустингу для World of Warcraft.
- Ноотропы OmniMind N°1 - Усиливает мозговую активность. Повышает мотивацию. Улучшает память.
- Санкт-Петербургская школа телевидения - это федеральная сеть образовательных центров, которая имеет филиалы в 37 городах России.
- Lingualeo.com — интерактивный онлайн-сервис для изучения и практики английского языка в увлекательной игровой форме.
- Junyschool (Джунискул) – международная школа программирования и дизайна для детей и подростков от 5 до 17 лет, где ученики осваивают компьютерную грамотность, развивают алгоритмическое и креативное мышление, изучают основы программирования и компьютерной графики, создают собственные проекты: игры, сайты, программы, приложения, анимации, 3D-модели, монтируют видео.
- Умназия - Интерактивные онлайн-курсы и тренажеры для развития мышления детей 6-13 лет
- SkillBox - это один из лидеров российского рынка онлайн-образования. Среди партнеров Skillbox ведущий разработчик сервисного дизайна AIC, медиа-компания Yoola, первое и самое крупное русскоязычное аналитическое агентство Tagline, онлайн-школа дизайна и иллюстрации Bang! Bang! Education, оператор PR-рынка PACO, студия рисования Draw&Go, агентство performance-маркетинга Ingate, scrum-студия Sibirix, имидж-лаборатория Персона.
- «Нетология» — это университет по подготовке и дополнительному обучению специалистов в области интернет-маркетинга, управления проектами и продуктами, дизайна, Data Science и разработки. В рамках Нетологии студенты получают ценные теоретические знания от лучших экспертов Рунета, выполняют практические задания на отработку полученных навыков, общаются с экспертами и единомышленниками. Познакомиться со всеми продуктами подробнее можно на сайте https://netology.ru, линейка курсов и профессий постоянно обновляется.
- StudyBay Brazil – это онлайн биржа для португалоговорящих студентов и авторов! Студент получает уникальную работу любого уровня сложности и больше свободного времени, в то время как у автора появляется дополнительный заработок и бесценный опыт.
- Автор24 — самая большая в России площадка по написанию учебных работ: контрольные и курсовые работы, дипломы, рефераты, решение задач, отчеты по практике, а так же любой другой вид работы. Сервис сотрудничает с более 70 000 авторов. Более 1 000 000 работ уже выполнено.
- StudyBay – это онлайн биржа для англоязычных студентов и авторов! Студент получает уникальную работу любого уровня сложности и больше свободного времени, в то время как у автора появляется дополнительный заработок и бесценный опыт.
|
---|