Шаблон:Short description
Шаблон:Refimprove
A hydrophilicity plot is a quantitative analysis of the degree of hydrophobicity or hydrophilicity of amino acids of a protein . It is used to characterize or identify possible structure or domains of a protein.
The plot has amino acid sequence of a protein on its x-axis , and degree of hydrophobicity and hydrophilicity on its y-axis . There are a number of methods to measure the degree of interaction of polar solvents such as water with specific amino acids. For instance, the Kyte-Doolittle scale indicates hydrophobic amino acids, whereas the Hopp-Woods scale measures hydrophilic residues.
Analyzing the shape of the plot gives information about partial structure of the protein. For instance, if a stretch of about 20 amino acids shows positive for hydrophobicity, these amino acids may be part of alpha-helix spanning across a lipid bilayer , which is composed of hydrophobic fatty acids. On the converse, amino acids with high hydrophilicity indicate that these residues are in contact with solvent, or water, and that they are therefore likely to reside on the outer surface of the protein.
Файл:RET Kyte-Doolittle-Hydropathy Plot RTAHIR.gif Kyte-Doolittle-Hydropathy Plot for Human RET proto-oncogene. Plot was created using the ExPASy Protscale tool (http://web.expasy.org/protscale/ ).
Файл:RET Hopp-Woods-Hydropathy Plot RTAHIR.gif Hopp-Woods-Hydropathy Plot for Human RET proto-oncogene. Plot was created using the ExPASy Protscale tool (http://web.expasy.org/protscale/ ).
Amino Acid Hydropathy Scores [1]
Amino Acid
One Letter Code
Hydropathy Score
Isoleucine
I
4.5
Valine
V
4.2
Leucine
L
3.8
Phenylalanine
F
2.8
Cysteine
C
2.5
Methionine
M
1.9
Alanine
A
1.8
Glycine
G
-0.4
Threonine
T
-0.7
Serine
S
-0.8
Tryptophan
W
-0.9
Tyrosine
Y
-1.3
Proline
P
-1.6
Histidine
H
-3.2
Glutamic acid
E
-3.5
Glutamine
Q
-3.5
Aspartic acid
D
-3.5
Asparagine
N
-3.5
Lysine
K
-3.9
Arginine
R
-4.5
The data in the above table was generated using a computer program that evaluates the average hydrophobicity of segments within a protein and uses data collected from literature.
References
Шаблон:Reflist
External links
Партнерские ресурсы
Криптовалюты
Магазины
Хостинг
Разное
Викиум - Онлайн-тренажер для мозга
Like Центр - Центр поддержки и развития предпринимательства.
Gamersbay - лучший магазин по бустингу для World of Warcraft.
Ноотропы OmniMind N°1 - Усиливает мозговую активность. Повышает мотивацию. Улучшает память.
Санкт-Петербургская школа телевидения - это федеральная сеть образовательных центров, которая имеет филиалы в 37 городах России.
Lingualeo.com — интерактивный онлайн-сервис для изучения и практики английского языка в увлекательной игровой форме.
Junyschool (Джунискул) – международная школа программирования и дизайна для детей и подростков от 5 до 17 лет, где ученики осваивают компьютерную грамотность, развивают алгоритмическое и креативное мышление, изучают основы программирования и компьютерной графики, создают собственные проекты: игры, сайты, программы, приложения, анимации, 3D-модели, монтируют видео.
Умназия - Интерактивные онлайн-курсы и тренажеры для развития мышления детей 6-13 лет
SkillBox - это один из лидеров российского рынка онлайн-образования. Среди партнеров Skillbox ведущий разработчик сервисного дизайна AIC, медиа-компания Yoola, первое и самое крупное русскоязычное аналитическое агентство Tagline, онлайн-школа дизайна и иллюстрации Bang! Bang! Education, оператор PR-рынка PACO, студия рисования Draw&Go, агентство performance-маркетинга Ingate, scrum-студия Sibirix, имидж-лаборатория Персона.
«Нетология» — это университет по подготовке и дополнительному обучению специалистов в области интернет-маркетинга, управления проектами и продуктами, дизайна, Data Science и разработки. В рамках Нетологии студенты получают ценные теоретические знания от лучших экспертов Рунета, выполняют практические задания на отработку полученных навыков, общаются с экспертами и единомышленниками. Познакомиться со всеми продуктами подробнее можно на сайте https://netology.ru, линейка курсов и профессий постоянно обновляется.
StudyBay Brazil – это онлайн биржа для португалоговорящих студентов и авторов! Студент получает уникальную работу любого уровня сложности и больше свободного времени, в то время как у автора появляется дополнительный заработок и бесценный опыт.
Автор24 — самая большая в России площадка по написанию учебных работ: контрольные и курсовые работы, дипломы, рефераты, решение задач, отчеты по практике, а так же любой другой вид работы. Сервис сотрудничает с более 70 000 авторов. Более 1 000 000 работ уже выполнено.
StudyBay – это онлайн биржа для англоязычных студентов и авторов! Студент получает уникальную работу любого уровня сложности и больше свободного времени, в то время как у автора появляется дополнительный заработок и бесценный опыт.