Представитель польского шляхетского рода Мышковских герба «Ястржембец». Сын дворянина королевского и бургграфакраковского Сигизмунда Мышковского (ум. 1578) и Беаты Пшерембской. Братья — каштелян жарновский Ян (ум. 1591), воевода равский Пётр (ум. 1600/1601) и каштелян освенцимский Александр (ум. 1617)
Возглавлял «королевскую» партию, которая выступала в поддержку политики Сигизмунда III Ваза и его планов по укреплению королевской власти. В 1597 году, во время пребывания в Мантуе был принят со своим братом Александром в род Гонзага. ПапаКлимент VIII дал ему титул маркграфа и это был единственный случай среди представителей шляхты Речи Посполитой. В 1601 году с согласия коронного сейма основал пиньчувскуюординацию.
15 марта1604 года присутствовал на тайной аудиенции Лжедмитрия у короля Сигизмунда III. Кроме Мышковского на встрече у короля присутствовали — епископы Петр Тылицкий (впоследствии подканцлер), Шимон Рудницкий, а также писарь великий литовский Гавриил Война[1].
Был женат на Эльжбете Богуш (ум. 1643), от брака с которой имел трёх сыновей и одну дочь:
Ян Мышковский (ум. 1621), 2-й ординат пиньчувский, староста новокорцинский
Фердинанд Мышковский (ум. 1647), 3-й ординат пиньчувский, староста гродецкий
